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--- neuroimagen:xnat_pipelines_registro [2020/12/11 15:18] – daniel
+++ neuroimagen:xnat_pipelines_registro [2020/12/11 16:25] (current) – [RegisterPETwithMRImatch: llamadas a los pipelets] daniel
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 {{ :neuroimagen:registerpetwithmri-resources_mri.png?nolink |}}
 ===== Generación del informe =====
@@ Line 79: / Line 81: @@
 **Nota:** Cuando un estudio PET no ha podido emparejarse con uno MRI, el usuario recibe un mensaje de error. Entonces, en el archivo CSV la columna de REGISTRATION_QA aparece vacía (y en MRI_EXPERIMENT_ID un valor que no corresponde a ningún experimento).
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 ===== Detalle de la implementación =====
@@ Line 138: / Line 142: @@
 **Nota:** Los pipelines de Xnat pueden usar llamadas a funciones Java del /pipeline engine/ para evaluar variables y expresiones y asignar valores a parámetros. En particular, ''fileUtils:getColumn'' y ''fileUtils:GetColumnList'', permiten obtener valores de un campo o de una lista de valores de un /ResultSet/ como el de arriba:
-  ''fileUtils:GetColumn(HOST, USER, PASSWORD, PATH, COLUMN)''
+<code>
-  ''fileUtils:GetColumnList(HOST, USER, PASSWORD, PATH, COLUMN)''
+ fileUtils:GetColumn(HOST, USER, PASSWORD, PATH, COLUMN)
+ fileUtils:GetColumnList(HOST, USER, PASSWORD, PATH, COLUMN)
+</code>
 Más detalles en el código fuente de [[https://github.com/NrgXnat/pipeline-client/blob/master/src/main/java/org/nrg/pipeline/client/utils/FileUtils.java|FileUtils]].
@@ Line 260: / Line 267: @@
 	fi
 )
 </file>
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