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neuroimagen:pgs

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neuroimagen:pgs [2022/12/07 10:39] – [Calculando WMH en XNAT] osotolongoneuroimagen:pgs [2022/12/07 10:55] (current) – [Calculando WMH en XNAT] osotolongo
Line 308: Line 308:
 y cuando haga la proxima busqueda estos resultados no apareceran. y cuando haga la proxima busqueda estos resultados no apareceran.
  
-Pero si sabemos que el output va a estar limpio porque no tenemos ningun fallo previo podemos hacer directamente, 
- 
-<code bash> 
-[osotolongo@brick03 mri_face]$ xnatapic get_jsession 
-73A409C58E6407C0E5F720746675D78C 
-[osotolongo@brick03 mri_face]$ for x in `xnatapic list_experiments --project_id mriface --modality MRI`; do if [[ -z `curl -f -X GET -b "JSESSIONID=73A409C58E6407C0E5F720746675D78C" "http://detritus.fundacioace.com:8088/data/experiments/${x}/files?format=json" 2>/dev/null| jq '.ResultSet.Result[].Name' | grep wmh.json` ]]; then echo ${x}; fi; done | xargs -I % sh -c 'xnatapic run_pipeline --project_id mriface --pipeline pgsWMH --experiment %' 
-</code> 
neuroimagen/pgs.txt · Last modified: 2022/12/07 10:55 by osotolongo