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neuroimagen:facehbi

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neuroimagen:facehbi [2019/06/07 09:04]
osotolongo [Integrar fechas con datos]
neuroimagen:facehbi [2020/03/05 09:56]
osotolongo [MRI] quitando reperitdos de v2
Line 352: Line 352:
 **Y ahora viene lo bueno pues hay que arreglar y/o rehacer toda la visita 2 por los posibles errores producto de esto.** **Y ahora viene lo bueno pues hay que arreglar y/o rehacer toda la visita 2 por los posibles errores producto de esto.**
  
 +m( **otro problema** hay algunos drop-outs que no he conseguido identificar y estan repetidos en la visita 2. Por suerte, alguien los ha encontrado pormi ;-).
 +
 +<code bash>
 +[osotolongo@detritus f2cehbi]$ cat delete.txt
 +F172
 +F176
 +F191
 +</code>
 +Las lineas que habria que borrar,
 +<code bash>
 +[osotolongo@detritus f2cehbi]$ for x in `cat delete.txt`; do grep ${x} *.csv; done
 +dates_mri.csv:F172,20151201
 +gdata_mri.csv:F172,0143,20121341,01.12.2015
 +guia_mri.csv:0143,F172
 +ids.csv:F172,143
 +info_mri.csv:F172,20121341,20151201
 +info_mri_proper.csv:F172,20121341,01.12.2015
 +internos.csv:F172,20121341
 +dates_mri.csv:F176,20151201
 +gdata_mri.csv:F176,0147,20150810,01.12.2015
 +guia_mri.csv:0147,F176
 +ids.csv:F176,147
 +info_mri.csv:F176,20150810,20151201
 +info_mri_proper.csv:F176,20150810,01.12.2015
 +internos.csv:F176,20150810
 +dates_mri.csv:F191,20151230
 +gdata_mri.csv:F191,0160,20151116,30.12.2015
 +guia_mri.csv:0160,F191
 +ids.csv:F191,160
 +info_mri.csv:F191,20151116,20151230
 +info_mri_proper.csv:F191,20151116,30.12.2015
 +internos.csv:F191,20151116
 +</code>
 +//Not so hard//,
 +<code bash>
 +[osotolongo@detritus f2cehbi]$ for x in `cat delete.txt`; do sed -i "/${x}/d" *.csv; done
 +</code>
 +:-P
 ==== FBB ====  ==== FBB ==== 
 one random file by subject, one random file by subject,
Line 509: Line 547:
 </code> </code>
  
-jodido problemas de permisos m(+jodidos problemas de permisos m( 
 +<code> 
 +[root@detritus ~]# chmod g+rwx /nas/data/subjects/facehbi_smc0003 -R 
 +..... 
 +[osotolongo@detritus facehbi]$ ls /nas/data/subjects/facehbi_smc0003/ 
 +bem  label  labels  morph  mpg mri 
 +[osotolongo@detritus facehbi]$ cat soloeste.csv  
 +0003;smc 
 +[osotolongo@detritus facehbi]$ precon.pl -cut soloeste.csv facehbi 
 +</code>
  
 ===== Reprocesamiento ===== ===== Reprocesamiento =====
neuroimagen/facehbi.txt · Last modified: 2020/08/04 10:58 (external edit)