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neuroimagen:dti_net_threshold

Estudiando como cortar la tractografia

La pregunta es esta. Tenemos una tractografia no estandard hecha en un grupo de sujetos. Podemos determinar la FA en las fibras que hemos calculado pero seguramente habra mucho ruido. Lo que deberiamos hacer es cortar el mapa de fibras por debajo de un valor y binarizar el resto para hacer la mascara. ¿Que valor umbral es el correcto?

Barremos los threshold para calcular la FA

$ dti_metrics_explore.pl -path DMN facehbi

y da igual cual escojamos, siempre que siempre sea el mismo. Voy a coger por defecto 25% porque es el mismo que estoy usando con los atlas de JHU.

Nota: Esto es un tubo y lo que se ve en la imagen es el perfil “parabolico” de velocidad del liquido. Puede ser interesante seguir por aqui.

neuroimagen/dti_net_threshold.txt · Last modified: 2020/08/04 10:58 (external edit)