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neuroimagen:dicom_report

Crear conjunto de DICOMs final

Esto son unos cuantos comandos que he utilizado para hacer el resumen de imagenes de los proyectos de Araclon.

Anonimizar

for x in `ls ab255_noanom/mri`; do dcanon ab255_noanom/mri/${x} AB255/mri nodesc $x $x; done

Reordenar

for x in `ls -d mri/*`; do a=`echo $x | sed 's/\[.*\]//'`; mkdir $a;done
for x in *\[*; do a=`echo $x | awk '{print $1}'`; mv "${x}" ${a}/dicom; done

Crear DICOMDIR

for x in *; do ../reorder.sh $x;done
reorder.sh
#!/bin/sh
dir=$1
cd $dir
find dicom/ -name "*.dcm" > dcm_files
dcdirmk -f dcm_files > dicomdir
rm dcm_files
cd ..
neuroimagen/dicom_report.txt · Last modified: 2020/08/04 10:58 (external edit)