neuroimagen:dicom_report
Crear conjunto de DICOMs final
Esto son unos cuantos comandos que he utilizado para hacer el resumen de imagenes de los proyectos de Araclon.
Anonimizar
for x in `ls ab255_noanom/mri`; do dcanon ab255_noanom/mri/${x} AB255/mri nodesc $x $x; done
Reordenar
for x in `ls -d mri/*`; do a=`echo $x | sed 's/\[.*\]//'`; mkdir $a;done for x in *\[*; do a=`echo $x | awk '{print $1}'`; mv "${x}" ${a}/dicom; done
Crear DICOMDIR
for x in *; do ../reorder.sh $x;done
- reorder.sh
#!/bin/sh dir=$1 cd $dir find dicom/ -name "*.dcm" > dcm_files dcdirmk -f dcm_files > dicomdir rm dcm_files cd ..
neuroimagen/dicom_report.txt · Last modified: 2020/08/04 10:58 by 127.0.0.1