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neuroimagen:cpac

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CPAC

Una opcion para preprocesar las imagenes fMRI es utilizar C-PAC.

Se instala bajando una imagen docker que he transformado a Singularity. Siguiendo la documentacion puede lanzarse como,

[osotolongo@brick01 mopead]$ singularity run --cleanenv -B /nas/data/mopead/bids:/bids_dataset -B /nas/data/mopead/cpac_out:/outputs -B /nas/data/mopead/tmp:/scratch /nas/software/cpac-latest.simg /bids_dataset /outputs participant --participant_label sub-0001

Nota: el tag –cleanenv es necesario para que singularity no tome las variables del bash_profile de la maquina sino las de la imagen.

neuroimagen/cpac.1557996349.txt.gz · Last modified: 2020/08/04 10:45 (external edit)