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genetica:wgs

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genetica:wgs [2020/05/20 08:37]
osotolongo [Opciones extra]
genetica:wgs [2020/07/03 21:04]
osotolongo [Programatic tree]
Line 3: Line 3:
 El objetivo es definir un procedimiento que procese un numero grande de secuencias WGS en el menor tiempo posible. Para ello,una vez definido el pipeline deberemos automatizar las tareas e integrarlas en el schedule manager del cluster ([[:cluster|Como usar el cluster sin morir en el intento]]).  El objetivo es definir un procedimiento que procese un numero grande de secuencias WGS en el menor tiempo posible. Para ello,una vez definido el pipeline deberemos automatizar las tareas e integrarlas en el schedule manager del cluster ([[:cluster|Como usar el cluster sin morir en el intento]]). 
  
 +** Nota: Aunque el script de ejecución final está integrado en el cluster de Fundació ACE, puede ser modificado fácilmente para integrarlo en cualquier otro cluster que use [[https://slurm.schedmd.com/|SLURM]] y probablemente pueda modificarse para otros //schedule managers//. **
 ===== tl;dr ===== ===== tl;dr =====
 <code> <code>
Line 207: Line 208:
 </code> </code>
  
-<code>+<code perl>
         $orderfile = $outdir.'/validate_'.$pollo.'.sh';         $orderfile = $outdir.'/validate_'.$pollo.'.sh';
         open ORD, ">$orderfile";         open ORD, ">$orderfile";
Line 467: Line 468:
 </code> </code>
 ++++ ++++
- +{{:genetica:its_fucking_cool.gif?300| 
-8-)+8-)}}
 ===== Ejecucion ===== ===== Ejecucion =====
  
genetica/wgs.txt · Last modified: 2020/08/04 10:58 (external edit)