#!/bin/bash ## area mris_preproc --fsgd v.fsgd --cache-in area.fwhm10.fsaverage --target fsaverage --hemi lh --out lh..area.10.mgh mris_preproc --fsgd v.fsgd --cache-in area.fwhm10.fsaverage --target fsaverage --hemi rh --out rh..area.10.mgh mri_glmfit --y lh..area.10.mgh --fsgd v.fsgd --C v.mtx --surf fsaverage lh --glmdir lh.a.glmdir mri_glmfit --y rh..area.10.mgh --fsgd v.fsgd --C v.mtx --surf fsaverage rh --glmdir rh.a.glmdir mri_glmfit-sim --glmdir lh.a.glmdir --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir lh.a.glmdir --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir rh.a.glmdir --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir rh.a.glmdir --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces ## thickness mris_preproc --fsgd .fsgd --cache-in thickness.fwhm10.fsaverage --target fsaverage --hemi lh --out lh..thickness.10.mgh mris_preproc --fsgd .fsgd --cache-in thickness.fwhm10.fsaverage --target fsaverage --hemi rh --out rh..thickness.10.mgh mri_glmfit --y lh..thickness.10.mgh --fsgd .fsgd --C .mtx --surf fsaverage lh --glmdir lh..glmdir mri_glmfit --y rh..thickness.10.mgh --fsgd .fsgd --C .mtx --surf fsaverage rh --glmdir rh..glmdir mri_glmfit-sim --glmdir lh..glmdir --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir lh..glmdir --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir rh..glmdir --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir rh..glmdir --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces ## volume mris_preproc --fsgd v.fsgd --cache-in volume.fwhm10.fsaverage --target fsaverage --hemi lh --out lh..volume.10.mgh mris_preproc --fsgd v.fsgd --cache-in volume.fwhm10.fsaverage --target fsaverage --hemi rh --out rh..volume.10.mgh mri_glmfit --y lh..volume.10.mgh --fsgd v.fsgd --C v.mtx --surf fsaverage lh --glmdir lh.v.glmdir mri_glmfit --y rh..volume.10.mgh --fsgd v.fsgd --C v.mtx --surf fsaverage rh --glmdir rh.v.glmdir mri_glmfit-sim --glmdir lh.v.glmdir --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir lh.v.glmdir --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir rh.v.glmdir --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir rh.v.glmdir --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces