#!/bin/bash var=$1 # everybody look to their left long_mris_slopes --qdec var${var}/qdec.table --meas volume --hemi lh --do-spc --do-label --stack-spc var${var}/lh.qdec.volume-spc.stack.mgh --isec-labels var${var}/lh.vqdec.fsaverage.cortex.label --time years --qcache fsaverage --sd /old_nas/subjects/ mri_glmfit --y var${var}/lh.qdec.volume-spc.stack.mgh --fsgd var${var}/vqdec.table.fsgd --C var${var}/vqdec.table.mtx --glmdir var${var}/lh.qdec.volume-spc.fwhm10 --surf fsaverage lh mri_glmfit-sim --glmdir var${var}/lh.qdec.volume-spc.fwhm10 --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir var${var}/lh.qdec.volume-spc.fwhm10 --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces # everybody look to their right long_mris_slopes --qdec var${var}/qdec.table --meas volume --hemi rh --do-spc --do-label --stack-spc var${var}/rh.qdec.volume-spc.stack.mgh --isec-labels var${var}/rh.vqdec.fsaverage.cortex.label --time years --qcache fsaverage --sd /old_nas/subjects/ mri_glmfit --y var${var}/rh.qdec.volume-spc.stack.mgh --fsgd var${var}/vqdec.table.fsgd --C var${var}/vqdec.table.mtx --glmdir var${var}/rh.qdec.volume-spc.fwhm10 --surf fsaverage rh mri_glmfit-sim --glmdir var${var}/rh.qdec.volume-spc.fwhm10 --cache 3 pos --cwp 0.05 --2spaces mri_glmfit-sim --glmdir var${var}/rh.qdec.volume-spc.fwhm10 --cache 3 neg --cwp 0.05 --2spaces # Can you feel that? Yeah grep -v "^#" var${var}/*h.qdec.volume-spc.fwhm10/*/*.summary